Misi LPPM Universitas Madako Tolitoli menetapkan kebijakan yang dapat mendukung terlaksananya penelitian berbasis kebutuhan keunggulan lokal dan regional serta meningkatkan akses dan relevansi perguruan tinggi berbasis kebutuhan dan keunggulan lokal dalam upaya membantu peningkatan mutu penelitian yang terwujud didalam upaya-upaya:

1. Mendukung Universitas pada bidang penelitian yang dilakukan oleh dosen maupun mahasiswa sebagai perwujudan dari pelaksanaan Tri Dharma Perguruan Tinggi;
2. Mendorong para dosen dan mahasiswa untuk menerapkan IPTEK dan seni yang telh diteliti dan teruji diperguruan tinggi untuk digunakan dalam mendukung pembangunan dan peningkatan kesejahteraan masyarakat;
3. Menghasilkan pemikiran-pemikiran yang kteatif, terpadu dan terarah berdasarkan kepada azas-azas pembangunan nasional yang diharapkan dapat digunakan sebagai masukan dalam menyusun konsep strategi pemberdayaan masyarakat untuk meningkatkan kesejahteraannya;
4. Dalam lingkup eksternal mendukung lembaga-lembaga baik pemerintah maupun swasta dalam menggali dan memanfaatkan serta mengelola hasil-hasil riset universitas serta potensi-potensi masyarakat dalam menunjang pembangunan;
5. menyelenggarakan berbagai program pendidikan dan pelatihan untuk menghasilkan sumberdaya profesional di bidang penelitian;
6. Mewujudkan dan menciptakan kemandirian LPPM Universitas Madako Tolitoli dalam menumbuhkembangkan profit centre melalui net working antara pakar di Universitas Madako Tolitoli sebagai sumber keilmuan dengan para profesional dilapangan sebagai sumber pengalaman;
7. Pengabdian kepada masyarakat diselenggarakan sebagai wujud hasil pendidikan dan penelitian yang dibutuhkan untuk pembangunan masyarakat.